Ez a káosz ideje. A Föld már nem az, ami volt. Megfertőzte egy bogárszerű faj, a Kék. A rejtélyes betegségben szenvedő Yuji Kaidót hibernált állapotba helyezik, amíg meg nem találják a gyógymódot a betegségére. Amikor felébred, Yuji megtudja, hogy már több mint 20 év telt el a hibernációja óta, és a világot már ezek a lények irányítják. Ekkor úgy dönt, hogy csatlakozik egy csapat katonához, akik a Kék ellen harcolnak egy jobb jövő reményében.